Обоснование: два молекулярных фенотипа сепсиса и острого респираторного дистресс-синдрома, что именуются как гипервоспаление и гиповоспаление, недавно были идентифицированы во множестве когорт с помощью анализа латентных классов и показали широкое расхождение в клинических исходах, а также различные ответы на лечение. При этом ключевые биологические различия между этими двумя фенотипами еще требуют изучения.
Цели: авторы использовали данные метагеномного секвенирования крови хозяина и микробов для лучшего понимания биологических различий между фенотипами, определенным при анализе латентных классов, и оценки согласованности между этими фенотипами с фенотипами, о которых сообщали другие исследовательские группы (к примеру, SRS1-2, MARS1-4, reactive/uninflamed).
Методы: анализу подверглись данные пациентов с сепсисом, включенных в два госпитальных проспективных когортных исследования, при этом 113 пациентов принадлежали гиповоспалительному фенотипу, а 76 пациентов — гипервоспалительному фенотипу.
Измерения и основные результаты: как гипервоспалительный фенотип, так и гиповоспалительный фенотип имели отчетливые сигнатуры экспрессии генов, при этом экспрессия 5 755 генов (31%) различалась. Гипервоспалительный фенотип ассоциировался с ростом экспрессии генов врожденной иммунной системы, в то время как гиповоспалительный фенотип ассоциировался с ростом экспрессии генов адаптивной иммунной системы, при этом наиболее заметной была экспрессия генов ответа Т-клетками. Анализ метагенома плазмы выявил различия в распространенности бактериемии, в численности и разнообразии бактериальной ДНК между фенотипами, при этом увеличение распространенности Enterobacteriaceae было характерно для гипервоспалительного фенотипа. Наблюдался существенный перекрест между этими фенотипами и ранее выявленным транскриптомными подтипами острого респираторного дистресс-синдрома (reactive/uninflamed) и сепсиса (SRS1-2). Анализ данных исследования VANISH показал, что кортикостероиды могут иметь губительный эффект у пациентов с гиповоспалительным фенотипом.
Выводы: гипервоспалительный и гиповоспалительный фенотипы имеют ясные транскриптомные и метагеномные характеристики, что может быть использовано для выбора точных стратегий терапии.