Введение: идентификация патогена имеет важнейшее значение при сепсисе и септическом шоке. Новое поколение метагеномного секвенирования (Metagenomic next-generation sequencing [mNGS]) обладает несколькими преимуществами по сравнению с традиционными микробиологическими тестами. С другой стороны, взаимосогласованность между mNGS и традиционными методами идентификации патогена требует дальнейшего изучения.
Цели: стремление авторов этой работы — оценка последовательности результатов между mNGS и традиционными тестами на патогены с выявлением факторов, что могут оказывать влияние на последовательность результатов.
Методы: систематический обзор и мета-анализ литературы, касающейся mNGS и традиционных микробиологических тестов, выявленной с помощью всеобъемлющего поиска в базах данных PubMed, Embase, Scopus, Web of Science и the Cochrane Library.
Результаты: в анализ было включено 27 исследований (4112 пациентов). Мета-анализ показал общую последовательность 0.319 ± 0.013 (p < 0.001), что указывает на умеренные взаимоотношения. В терминах «тип пробы» спинномозговая жидкость показала наилучшую общую kappa последовательность 0.500 ± 0.029 (p < 0.001). Иммуноскомпроментированные пациенты показали наихудшую общую kappa последовательность 0.294 ± 0.014 (p < 0.001) по сравнению с 0.321 ± 0.028 (p < 0.001) у иммунокомпетентных пациентов. Положительная процентная согласованность mNGS перед традиционными методами составила 83.63%, тогда как отрицательная процентная согласованность составила 54.95%.
Выводы: этот обзор показал умеренную взаимосвязь между mNGS и традиционными методами выявления патогенов, указывая на сложные взаимодействия между этими двумя методами. Стерильные пробы показывают наилучшую последовательность, чем не стерильные пробы. Недостаточная иммунная функция может снижать взаимосогласованность между mNGS и традиционными микробиологическими тестами. Необходимы дальнейшие исследования применения mNGS при сепсисе и септическом шоке.
Подробнее: https://ccforum.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13054-025-05288-9
Наш сайт работает без рекламы, и мы рады, что вы с нами! Для поддержки проекта и его развития сканируйте QR-код ниже!
